萬科否認降薪，稱只是調整結構和發放節奏。深鐵剛剛成為第一大股東，萬科就調整薪酬結構了。萬科稱根據市場和行業情況、戰略重點及當前任務，適時調整薪酬激勵政策，是企業慣例，和股東結構變化沒有任何關系。還強調稱，本次調整的方向，不是降低薪酬，而是調整結構和發放節奏。

萬科同時強調，調整導向為更加鼓勵真實價值創造，鼓勵通過努力把蛋糕做得更大，讓全體股東獲得更高回報的同時，讓員工獲得與業績相匹配的收入，保證公司持續健康發展。

6月13日，媒體曝出一封由萬科集團人力資源部于6月1日發布的內部郵件顯示，“面對地產‘黃金時代’的結束，公司更加強調真實價值創造，集團薪酬政策將據此進行分步調整。”

坊間流傳，萬科員工季度獎金將大幅降低，年終EP(經濟利潤)獎金的發放規則也將修改。還有觀點將此次調整與深鐵成為萬科第一大股東聯系起來，認為萬科被國資大股東管控而要降薪。

另有消息指出，近期萬科旗下部分地方公司已準備下調員工工資，獎金部分降幅超過工資。有媒體指出，萬科此前推行的跟投制度同樣發生變化，公司為員工提供的杠桿可能會被取消，原因則是“不符合國企規定”。